Jean-François Charles est un scénariste et dessinateur belge de bande dessinée, né le 19 octobre 1952 à Pont-à-Celles (province de Hainaut).
Il étudie à l’Académie royale des beaux-arts de Bruxelles et commence sa carrière en 1971 dans le dessin de presse. Se réorientant vers la bande dessinée, il entame une collaboration avec le Journal de Spirou : Les Belles Histoires de l'oncle Paul (1975), Les Chevaliers du pavé (1977). C’est dans Spatial, une revue belge éditée par Michel Deligne, qu’après plusieurs courts récits scénarisés par Jan Bucquoy, il dessine l’histoire Le Bal du rat mort, toujours sur un scénario de Bucquoy.
Sa première série, Les Pionniers du Nouveau Monde, paraît chez Deligne à partir de 1982. Après le rachat du catalogue de cet éditeur par Glénat, il poursuit Les Pionniers et développe de nouvelles séries chez Glénat, et plus tard chez Casterman.
En 2004, Jean-François Charles a illustré des romans sur Alix, certains adaptant des histoires parues en bande dessinée, d’autres étant inédits (Le Sortilège de Khorsabad, L’Ombre de César).
Il a épousé la scénariste belge Maryse Nouwens, avec laquelle il coécrit India Dreams et War and Dreams. Avec l'illustrateur Frédéric Bihel, les deux scénaristes publient la série Africa Dreams, qui « porte sur l'histoire du Congo belge » et dont les quatre tomes paraissent entre 2010 et 2016. Ce récit « dessine sa face sombre » des actions de Léopold II au Congo belge.
En 2018, ils entament ensemble une nouvelle série, China li.